兒盟首先呼籲，行政院應比照日本做法，另設「兒童及少年事務委員會」。因為未來的「兒童及家庭署」位階僅是三級機關，遇到跨部會協調時恐怕權限有限。兒盟建議仿效日本2023年成立的「兒童家庭廳」模式，讓行政院下的委員會負責國家級政策，例如少子化對策、育兒支持、兒少身心健康、兒虐防治等，再由「兒童及家庭署」配合同步推動。
兒盟也指出，中央組織改造雖自2013年開始，但兒少政策仍長期呈現「有整沒有合」的困境，衛政、社政分工繁雜，整合效果不彰。未來的「兒童及家庭署」應以「兒少最佳利益」為核心，將所有與兒童、家庭相關、且有利其發展的政策都納入一條龍管理，真正做到跨域合作，不再陷入部門分割。
最後，兒盟直言最重要的關鍵是「人力」。目前社會及家庭署編制不到150人、保護服務司更不足50人，兩單位合計不到200人，要承擔全國兒少與家庭福利業務早已人力吃緊。兒盟強調，新設的「兒童及家庭署」不能只是把既有人力重新洗牌，而必須大幅擴編，才足以推動完整的兒少政策。