首次公開的影像顯示，國務卿樞機帕羅林（Cardinal Pietro Parolin）在教宗方濟各的靈柩前祈禱。畫面中可見教宗穿著紅色祭衣、戴著主教冠，安息在木製棺木之中，地點為他在梵蒂岡的私人小堂。
梵蒂岡方面表示，方濟各是因中風陷入昏迷，最終心臟衰竭而辭世。
方濟各教宗因長期罹患肺部疾病，且年輕時曾切除部分肺部，他於2025年2月14日因呼吸危機入院，病情後來發展成雙側肺炎。他在院共留醫38天，這是他十二年教宗任期中最長的一次住院。
他在辭世前一天——復活節主日——進行了最後一次公開露面，於聖伯多祿廣場為成千上萬民眾降福，引來群眾熱烈歡呼與掌聲。在進行祝福前，他還會見了美國副總統范斯（JD Vance）。他當時站在與2013年3月13日剛被選為第266任教宗時相同的陽台上，為人群降下最後的祝福。
樞機主教們今天齊聚梵蒂岡，安排方濟各的安葬事宜，同時籌劃選舉繼任教宗的秘密會議（宗座選舉會議），並就天主教會的其他運作事項作出決策。在全球政要與信徒哀悼這位教宗逝世之際，他們也將決定何時將方濟各的遺體移入聖伯多祿大殿，供民眾瞻仰致敬。
在遺囑中，方濟各確認自己將安葬於聖母大殿（Basilica di Santa Maria Maggiore），這座位於梵蒂岡之外的聖殿收藏著他最鍾愛的聖母畫像。他每次出國返抵羅馬後，都會前往該殿，於這幅拜占庭風格的聖母像前祈禱。
3月23日，在結束38天的住院療養後，方濟各返家途中特地繞行聖母大殿，獻上鮮花，獻放於聖母像前；4月12日，他再度前往，於聖母像前做了最後一次祈禱。