2026年APEC峰會將在中國深圳舉行，中國國台辦表示未來將按照慣例處理「台灣地區」參會事宜。中國外交部今表示，「中華台北參與APEC活動的關鍵，在於遵守『一中原則』與相關的APEC諒解備忘錄，而非任何安全問題」。針對中方回應，我國外交部強烈抗議，並稱中國附加條件已經違反承諾，將會協調理念相近國共同反制。
對此，林憶君表示，當然希望台灣能依循往例、積極參與APEC相關活動，但前提仍必須是在對等尊嚴的原則之下前往中國參與會議，也希望中方能尊重台灣的主權地位，展現其誠意與格局。
林憶君續指，台灣本來就是APEC的正式會員，理應享有原有的地位與權利，因此，她認為台灣按照既有模式持續參與毫無違和，不應受到任何國家企圖用政治因素阻擾的前提下限制參與，因此，期盼台灣明年還是能依循往例模式參加出席APEC。
林憶君強調，距離APEC峰會仍尚有一年的時間，希望賴政府要相信兩岸關係還是需要透過理性和平的交流與對話，積極推動兩岸在這段時間能夠持續溝通，建立「善的循環」，為兩岸共謀和平、為人民共謀福祉。
林憶君說，兩岸唯有建立在「互相認識、互相了解、互相尊重、互相合作、互相諒解」這五個互相的基礎上，才能創造良性互動的空間，也才更有機會讓台灣能在平等、尊嚴的地位下參與APEC，共同創造亞太區域的穩定與繁榮。