國安會表示，依據《中華民國憲法增修條文》第2條第4項及《國家安全會議組織法》第2條第1項規定，國安會為「總統決定國家安全有關大政方針之諮詢機關」，並非政策執行與處置機關，除涉及國安會議有關的法律案及預算案經程序送立法院審議外，不宜至立法院報告備詢，以符憲政體制。
國安會議遵循與歷任政府一致之體制及慣例，並已於本月18日正式去函立法院司法及法制委員會及會議主席說明。
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其實過去國民黨主政時期，國安會就鮮少出現，據立法院會議記錄顯示，前總統馬英九時代的前任國安會秘書長袁健生，就對立法院表示，依據憲法增修條文第2條第4項及國安會組織法第2條第1項規定，國家安全會議是總統決定國家安全有關之大政方針的諮詢機關，因此國安會僅是幕僚，非主官；第二，就憲政慣例，對立法院負責的是行政院，不是總統府。故國安會不宜到立法院列席。