疾管署表示，考量國際間新冠疫苗接種建議從「普遍接種策略」轉為「風險族群導向策略」，衛福部決議調整今年秋冬新冠疫苗接種對象為以下10類對象：
1.65歲以上長者
2.55-64歲原住民
3.安養、長期照顧(服務)等機構之受照顧者及其所屬工作人員。
4.孕婦
5.6個月以上高風險對象，包含符合流感疫苗高風險對象條件（高風險慢性病人、BMI≧30者、罕見疾病患者及重大傷病患者），以及結核病、失能（注意力不足及過動症、腦性麻痺、先天性缺陷、發展或學習障礙、脊髓損傷）、精神疾病（情緒障礙、思覺失調症）、失智症患者。
6.醫事及衛生防疫相關人員
7.幼兒園托育人員、托育機構專業人員，以及及居家托育人員(保母)。
8.6個月內嬰兒之父母
9.滿6個月以上至未滿6歲幼兒
10.50-64歲無高風險成人
疾管署說明，今年秋冬公費新冠疫苗已依上述ACIP建議預計採購307萬劑，包括莫德納LP.8.1疫苗約277萬劑和Novavax JN.1疫苗30萬劑，將延續「左流右新」共同接種策略，規劃自今年10月1日起與流感疫苗同步分2階段開打，其中除50-64歲無高風險成人於第2階段於11月1日起開打，其餘對象皆於第1階段開打。
此外，對於目前使用的莫德納JN.1疫苗，疾管署補充，將持續提供滿6個月以上全民接種至9月30日止。