由於花東地區相對西部僅台鐵與單一公路的交通路網，且一遇地震、颱風影響極大，若以這次台鐵票價漲幅東部對外路線最高50%計算，將對花東居民增加極大負擔。
花蓮縣政府則重申，交通建設如蘇花安、花東快速道路等尚未完工前，不應調漲花蓮至台北間的鐵路票價，並建議台鐵應優先以開源節流為原則，而非將營運成本轉嫁予乘客，盼中央儘速提出具體回饋方案，以維護東部居民的交通權益。
花蓮縣觀光協會也質疑，在台鐵2021年太魯閣號事故與多次天災後，鐵路安全仍未讓人放心，如今卻逕行調漲票價，「應先讓民眾對搭車安全有信心，再談漲價」，並呼籲台鐵應規劃更具彈性的票價制度，照顧花東居民的實際需求。
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對此，台鐵總經理馮輝昇回應，針對花東地區居民的優惠措施已在研議中，具體內容與實施時間尚待確定。
交通部政務次長、台鐵公司代理董事長伍勝園表示，台鐵將依據行政院指示，規劃針對設籍於花蓮、台東的民眾提供比會員制更優惠的票價方案，預計最快可望與6月23日票價調整同步上路。
此外，台鐵也將在新票價上路後，於6月25日起實施列車改點，針對需求高的路線投入更多列車行駛，預計以台北至台中、台北至豐原及台中至高雄等台鐵相對有競爭力的路線提供更多班次。