消息人士指出，包括座艙語音紀錄器、電腦數據，以及在殘骸中發現的發動機實體開關證據顯示，機師在接近預定降落時間前不久發生鳥擊事件後，採取緊急措施，關閉了左側發動機，而非右側發動機。
根據中央社，調查人員19日向罹難者家屬簡報時指出，鳥擊造成右側發動機受損程度較嚴重，並有間接證據顯示，機師當時關閉的是受損較輕的左側發動機。
不過罹難者家屬律師表示，家屬對報告似乎把責任歸咎於機師，卻未探討其他肇因，而反對公開調查結果，原定當天舉行記者會也因此取消。
罹難者家屬代表及濟州航空機師工會於週末期間表示，調查重點應該放在水泥牆本身。航空專家認為，水泥牆可能是造成傷亡嚴重的主要原因。
機師工會指出，韓國航空及鐵道事故調查委員會（ARAIB）在2具發動機內均發現鳥類遺骸的情況下，仍主張被關閉的左側發動機無問題，是在「誤導民眾」。
機師工會指控ARAIB未能提出科學與技術依據證明只靠左側發動機仍可安全降落飛機，企圖將機師當成「代罪羔羊」。