Sanook報導，雖然「椰子水」是天然且有益健康的飲品，能補充身體水分，並富含鉀、鎂及多種維生素等重要礦物質，但對某些人來說，喝椰子水可能弊大於利。尤其以下兩類高風險族群，醫師警告應謹慎或避免飲用：
心律不整患者
椰子水含有高鉀，雖然鉀通常對心血管系統有益，但若心律不整患者攝取過多鉀，可能嚴重影響心臟功能，甚至危及生命。
腎臟病或腎功能衰退患者
椰子水內的礦物質，如鉀、鈉和氯化物，會刺激排尿，若腎功能異常，恐導致體內水分與電解質失衡，進而引發心臟衰竭或其他併發症。
泰國公共衛生系統研究院院長蘇帕吉‧西里拉克（Supakit Sirilak）醫師指出：「椰子水屬於營養價值高的飲品，但對腎功能衰退者並不適合，因為椰子水會促進排尿，若身體缺水，腎臟病患恐發生心臟衰竭；而心律不整患者若體內鉀含量過高，也可能對心臟造成危害，甚至有致命風險。因此，消費者應適量飲用」。
此外，椰子水本身含有天然糖分，每顆椰子約含7-25公克糖，糖分多寡取決於椰子的成熟度，其中嫩椰的含糖量會高於老椰。至於糖尿病患者，雖「可以喝椰子水」，但不宜攝取過量，以免導致血糖瞬間飆升，提高併發症風險。
醫師也建議：
每天飲用不超過1顆椰子的量、選擇不添加糖的椰子水，若飲用瓶裝或盒裝椰子水，可能含有添加物，應仔細閱讀標示、對於一般健康的人而言，椰子水是營養豐富的飲品，適量飲用有助於運動後恢復體力，促進排便，部分礦物質如鋅、錳，還可能對生殖系統有正面幫助。