小林製藥紅麴案造成104人死亡、逾5000人送醫，從1月傳出第1起中毒案例到3月才對外公開，整整超過2個月，挨批應變太慢，產品也未及時回收，連帶造成約79億日圓（約17.38億台幣）的相關損失，壓垮這間百年老店，84歲的董事長小林一雅與擔任社長的53歲兒子小林章浩雙雙宣布請辭，並首度引入外部人士接任社長。
小林製藥8日召開董事會宣布，決定退出紅麴事業，不過仍會繼續處理顧客與業務夥伴的相關賠償問題，原因也會查明到底。先前辭職的小林章浩社長已表明會以董事身分繼續負責。
根據《MBS》，董座小林一雅擔任公司特別顧問，每月領取高達200萬日圓（約44萬台幣）顧問費，是公司規定的4倍之多，預料他會歸還一部分報酬。
小林製藥1886年創立，1919年在大阪成立公司，至今一直由創辦人家族擔任社長，是不折不扣的家族企業。現年84歲的小林一雅自1976年至2004年擔任第4代社長，53歲的長子小林章浩則從2013年起出任第6代社長，2人請辭後，山根聰將成為首位非家族出身的社長。