小林紅麴案影響層面極廣，不過公司應變太慢，從1月傳出第1例到3月才對外公開整整超過2個月，也未及時回收產品；當局雖然還在確認紅麹與中毒是否有因果關係，不過事件造成81人死亡、逾5000人送醫，高層難辭其咎，在外部董事要求下，決定更換領導階層。
小林製藥1886年創立，1919年在大阪成立公司，至今一直由創辦人家族擔任社長，是不折不扣的家族企業。現年84歲的小林一雅自1976年至2004年擔任第4代社長，53歲的長子小林章浩則從2013年起出任第6代社長，2人請辭後，山根聰將成為首位非家族出身的社長。
小林章浩卸下社長身分後，仍將以董事身分負責處理相關賠償問題。