黨內矛盾爆發
第二波罷免投票失利後，民進黨立院黨團矛盾徹底引爆。24日，幹事長吳思瑤、書記長陳培瑜、副書記長郭昱晴、林月琴、副幹事長林楚茵相繼表態辭職，王義川也宣布不再續任副幹事長。吳思瑤甚至直言，柯建銘多次打電話慰留，但她「都不敢接」。
批判聲浪接連而至。郭國文率先發難，直指柯建銘「假傳聖旨、忽視意見」；林淑芬則痛批「黨團毫無討論，直接下達命令，還威脅跑票者開除」；賴瑞隆表態支持「全面改選」；林俊憲也說，改組已成黨內共識。素來與柯對立的王世堅，更在罷免失敗後送他一包衛生紙，要他「自己擦屁股」。
但也並非所有人都選邊倒戈。蘇巧慧被問及柯是否該下台時回應，柯的經驗與資歷是黨的重要資產，「其實無人可以取代」；前立委鄭運鵬也聲援說，「幫忙喬事情的人，難免遇到爭議，這時候又嫌他形象不好，這樣怎麼辦呢？」、「何必對柯總召那麼刻薄？」
柯建銘本人面對逼宮仍舊未表退意，並以「七步詩」回應：「大罷免是窮盡一切可能讓國會過半，何錯之有？難道罷團也錯了嗎？」
「萬年總召」的崛起與包袱
柯建銘熟稔議事規則、法案功力深厚，歷經陳水扁時代跛腳執政、馬英九執政時的在野困境，也在蔡英文任內的完全執政中擔任關鍵角色，因而獲「萬年總召」之名。他的著作《大局，承擔》中，蘇貞昌讚賞柯「能與各方交好，既能挑戰國民黨，又能溝通互動」、「政治必須耐煩、耐辱，他甚至還能耐操」。蔡英文也回憶，2008年民進黨僅27席立委時，柯總召靠靈活戰術與專業問政，讓少數黨聲音極大化，「這樣的功力，黨內實在不做第二人想」。然而，隨著國會生態改變，柯建銘的「老派總召」模式也面臨挑戰。
鍾佳濱呼籲「重啟新局」 引柯建銘名言提醒自己
民進黨立委鍾佳濱提醒，抓戰犯無助解決問題，重點是「重啟新局」，先確立黨團方向與目標，再談人事調整。他說，「至少要清楚黨團自己的定位，不然如何前進？難道處理掉戰犯，戰敗就不見了嗎？」。
鍾佳濱憶及，柯建銘過去很柔軟，能與藍營的費鴻泰、王金平談判，甚至能配合任何幹事長，被各派系接受，柯曾說，「我當總召，誰當幹事長我都可以配合」，表示柯建銘有彈性，能與任何人合作。
鍾佳濱指出，柯建銘的黃金時代是與馬英九執政時的立法院長王金平談判。他坦言，「跳探戈，是兩人要有差不多的功力，若兩人功力不相稱，探戈也跳得不漂亮，老柯現在可能找不到一個可以與他跳探戈的人」。
鍾佳濱回憶柯建銘曾說過：「國會的少數派唯有透過談判，才有可能取得略大於己方實力的成果，一味的杯葛到底、破壞，甚至拒絕談判，只會讓少數派一事無成，輸到脫褲子」，如今，這句話也像是在提醒柯建銘自己。
學界分析：沒人能接班老柯
東吳大學政治系助理教授陳方隅指出，民進黨最大困境在於「沒有人能取代柯建銘」。整個黨團乃至政策協調，幾乎全靠「老柯系統」。若此刻換人，恐難有人接得上。
但他也批評，柯建銘對現況判斷失準。藍白陣營如今採「堅壁清野、全面拖垮」戰術，而立法院長韓國瑜在國會失去功能，很少主持協商、又不主導議事，議程反由國民黨立委傅崐萁、翁曉玲主導，「這讓老柯難以接受，他也沒有認清國會已經是四處放火、不講理的局面」。
目前黨內傳出有意拱出前副院長蔡其昌接任總召，但蔡其昌僅回應「總召改選要到明年二月，沒有什麼好回答的」，即使被問是否願意承擔，他也僅說「承擔是大家需要你，才有你承擔的問題，這不是我能回答的」；至於被點名接任幹事長的蘇巧慧，則婉拒表示「黨內比我適合的人很多」。
陳方隅認為，以資歷來看，蔡其昌、莊瑞雄都有能力承擔，但可能還要面臨黨內人和與派系問題，而「柯建銘之後」的局面，仍是民進黨最嚴峻的考驗。
