行政院表示，行政院秘書長將由現任總統府副秘書長張惇涵接任，張惇涵從地方到中央政府行政及政務資歷完整，對於政府政策熟稔，未來將發揮溝通長才協調鼎鼐。
現任行政院龔明鑫秘書長則將接任經濟部長，龔明鑫曾任國發會主委及經濟部政務次長，接下來將為國家整體經濟策略掌舵，為台灣產業、貿易及經濟基礎建設確立下一個階段的根基。
現任僑務委員會阮昭雄副委員長將接任行政院副秘書長，持續與立法院朝野各黨團保持暢通的溝通管道，其副委員長職缺將由前新竹市議員李妍慧接任。
為實踐賴總統運動及體育政見，推展全民運動、推動競技運動全民化並打造台灣品牌的國際賽事等政策，運動部將於9月9日成立，並擬由2020年及2024年連兩屆奧運羽球男子雙打金牌得主李洋接任運動部部長。
現任體育署署長鄭世忠以及國家運動科學中心執行長黃啟煌接任政務次長，現任體育署副署長洪志昌將接任常務次長，期望藉由最瞭解運動及體育競賽經驗的人才，透過運動體育壯大台灣。
國家發展委員會主任委員將由前中華經濟研究院院長葉俊顯出任，葉俊顯長期為政府提供建言，對於國內產業政策非常瞭解，期盼未來能夠持續發揮專業及溝通專才，為政府勾勒政策藍圖。
推薦新聞：726後卓榮泰多次請辭被慰留！賴清德：執政團隊會做「4項調整」
衛生福利部將繼續實踐賴清德總統「健康台灣」的重要政策，未來將由現任中央健康保險署石崇良署長擔任部長，並由現任疾病管制署莊人祥署長擔任常務次長。
石崇良及莊人祥不僅在過去Covid疫情肆虐全球期間為台灣奠定堅實的防疫基礎，也透過記者會方式向國人說明疫情發展狀況，期望未來也能夠透過專業與對外溝通能力，殷實推動「健康台灣」的政策。
數位發展部則將由現任次長林宜敬接任部長，其職缺將由現任台灣人工智慧學校基金會秘書長侯宜秀律師接任，期望透過兩人的專業，擘畫未來創新科技、開放資料、開放政府等數位治理議題及相關法律規範。
此外，環境部政務次長將由現任化學物質管理署謝燕儒署長接任；教育部政務次長將由銘傳大學電機工程學系劉國偉講座教授接任；原住民族委員會副主任委員將由前棒球選手陳義信接任。
李慧芝指出，卓院長將於明（28）日行政院院會後，帶領內閣團隊新成員，向國人報告「AI行動內閣2.0」的新隊形。