台灣事實查核中心今晚在臉書發文指出，疾管署今年總預算為121億元，其中防疫業務預算編列94.89億元，雖然沒有針對防疫業務刪減預算，但立法院院會通過「通案刪減」決議，針對各政府機關預算統刪，所以疾管署預算也受到影響。
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台灣事實查核中心表示，適用於疾管署「防疫預算95億」的通刪項目有：委辦費10%、房屋建築養護費5%、車輛及辦公器具養護費5%、設施及機械設備養護費5%、國內旅費20%、水電費10%、媒體政策及業務宣傳費60%，以上估算約統刪至少3783萬元，並非部分政治人物宣稱的一塊錢都沒有刪。