據《鏡週刊》報導，柯文哲8月爆出政治獻金申報不實，檢調就開始清查他如何處理金流，還原他手機後發現，他傳LINE給木可公司負責人李文娟，下令「妳桌上的木可帳，把它碎掉」，後辦案人員也證實，木可公司的內帳已全遭滅證。
而檢廉在清查時，發現8大金庫密帳幾乎屬實，柯文哲將未登記的獻金、賄款等整合，分配給多位核心幹部統籌運用，包括大選期間電台宣傳經費，知情人士透露，有「戰狼小姐姐」稱號的民眾黨立院黨團主任陳智菡，被柯文哲指定負責政論節目宣講，「妳現在是比特犬，直接出去攻擊」，並給她1千萬預算。
其他還有以新故鄉智庫協會等單位名義支付近3千萬，各地的地方電台共拿2556萬餘元。柯文哲涉嫌侵占並挪用政治獻金，成立眾望基金會、新故鄉智庫協會與木可公司，加上涉嫌收受沈慶京行賄款等罪，全案預計12月下旬起訴。