林宜瑾因涉詐領助理費，日前被台南地檢署認為涉嫌違反《貪汙治罪條例》中「非公務員與公務員共同犯利用職務機會詐取財物」、「使公務員登載不實公文」等罪嫌，經6小時漏夜偵訊後，諭令以新台幣100萬元交保。
《菱傳媒》27日報導則指出，檢調掌握到的關鍵證據是，找到林宜瑾拿著助理的提款卡領錢的畫面及交易記錄，而當時該名助理正在服兵役，理應不能申報助理費。
對此林宜瑾則解釋，當時在台北開會，但因為是「跟會」的繳款日期，所以臨時向助理借提款卡，事後也已還錢給助理。相關人員指出，該名助理入伍前將薪轉帳戶存摺及提款卡，交由黃品瑜保管，疑似因為林宜瑾服務處沒有撤銷他的助理資格，以致政府持續撥發助理費，檢方將對此紕漏進行後續調查。