新冠疫情方面，第44週門急診就診1,398人次，與前週相當，主流變異株為NB.1.8.1。疾管署表示，國內疫情低點波動，但鄰近國家如中國、香港、日本、韓國仍以NB.1.8.1為主要變異株，全球多地陽性率呈上升趨勢。
疾管署提醒，符合公費疫苗資格的民眾應儘速接種流感及新冠疫苗，以降低感染及重症風險。公費流感及新冠疫苗自11月1日起開放第二階段50至64歲無高風險慢性病成人接種，而65歲以上長者及其他第一階段對象若尚未接種，也應盡快前往合約院所施打。11月12日起，Novavax JN.1疫苗將加入國內公費供應，12歲以上可擇一疫苗接種。
截至11月3日，全台公費流感疫苗接種數約477.8萬人次，新冠疫苗累計約106.1萬人次，均較去年同期增加1.2倍。疾管署也提醒，近期氣溫變化大，應落實勤洗手、戴口罩及生病在家休息等措施，並注意呼吸困難、血痰、胸痛或意識改變等危險徵兆，及時就醫降低重症風險。