一、 裝備保護：
清理時切勿赤手赤腳、穿拖鞋，以及直接接觸汙水、汙泥或災害廢棄物，務必穿著雨鞋或防水長靴、配戴防水手套及口罩，避免被生鏽器物(如鐵釘、鐵片等)刺傷或割傷，以防感染鉤端螺旋體病、類鼻疽、破傷風等傳染病。
如出現發燒、頭痛、肌肉痛、腹痛、腹瀉、黃疸、倦怠等症狀，請儘速就醫，並主動告知醫師相關接觸史、受傷原因及傷口污染情形，以利醫師診療。
二、 飲食保護：
水災地區蓄水池如遭汙水侵入，應確實清洗、消毒後再蓄水；食物飲水要煮熟煮沸，食物保存過久或變質(泡過水或解凍過久等)請勿再食用。
三、 清潔保護：
戶外區域可用市售含氯漂白水稀釋50倍(200cc加10公升水)噴灑庭院、水溝等潮濕處；居家環境可用市售含氯漂白水稀釋100倍(100cc加10公升水)擦拭或刷洗地板、牆壁、廁所等處。至於廚具及餐具應煮沸消毒或用10公升清水加40毫升漂白水浸泡30分鐘稀釋進行消毒，並以清水沖洗乾淨後再使用。
同時應注意手部清潔，依「濕、搓、沖、捧、擦」五步驟正確洗手；如暫時無法取得清水，且手部無明顯髒汙，可改用酒精含量75%的乾洗手液清潔雙手。
疾管署說明，因應志工持續投入救災，今天早上光復火車站志工站已開始免費發放口罩，花蓮縣衛生局亦備有漂白水放置在醫療站，今天開始發放給前來索取的民眾，並將安排請當地志工和村里長協助逐戶發放，疾管署全力支援花蓮災後防疫與傳染病監控工作。