衛福部表示，自樺加沙颱風發布海上警報以來，已啟動八大應變措施，包括撤離孤島地區洗腎患者及孕產婦、掌握緊急醫療網絡運作、調度災難醫療隊、災區看診與送藥支援、災民收容安置及心理照護、社工關懷，以及防疫監控等，保障民眾就醫與用藥權益。截至24日上午7時，急救責任醫院已收治49名傷病患，其中33人已出院。
在災民收容與安置方面，目前光復高職體育館安置169人、大進國小306人、萬榮國小4人、鳳林樂活會館29人，共計508人。民間社福團體及社工已進駐安置所協助物資分發、急難需求處理及家庭受災狀況確認。若民眾因洪水遺失健保卡或處方，衛福部花蓮醫院、慈濟醫院及門諾醫院等皆派員協助看診與領藥，並有無人機送藥團隊評估支援需求。
在醫療與心理照護方面，花蓮醫院派醫師、護理師及行政人員支援醫療救護站，玉里醫院也派心理健康團隊提供心理輔導。衛福部社工司與花蓮縣政府協力，提供一戶一社工關懷死亡家屬及傷者，同時與慈濟、家扶、世界展望會等民間團體合作，災後防疫也持續加強，尚無疫情或群聚事件發生。