目前使用的昆陽實驗室已有60年歷史，空間狹小、設施老舊，早已不符現代防疫需求。為提升應對新興傳染病的能力，疾管署在行政院同意下於2020年開始籌劃，歷經文化審議與設計規劃，終於在今天動土。未來中心將設有高防護實驗室、生物製劑廠與國家級實驗室，還會將部分歷史建築保留下來，打造結合新科技與文化傳承的綠建築。
建築師劉培森表示，新大樓會分為行政區與實驗區，並力拚通過黃金級綠建築認證，目標打造節能又安全的工作環境。其中，行政大樓將成為國家衛生指揮中心的主要據點，而實驗大樓則涵蓋多種先進設備與功能。設計上也融合了原有的歷史元素，展現「以過去重建未來」的理念。
推薦新聞：壹蘋10點強打｜鬼鬼生完女兒住處升級 千萬小窩變6千萬豪宅（狗仔直擊）
衛福部長邱泰源致詞時特別感謝總統推動「健康台灣」，並指出新防疫中心落成後，昆陽園區將整合衛福部、食藥署與疾管署等單位，提供民眾更便捷的服務，提升整體生活品質，也能帶動南港周邊發展。邱部長也感謝國土管理署與工程單位的協助，確保工程品質與進度。
總統賴清德在致詞中強調，「健康」和「環境」息息相關，這次防疫中心的建設，不只強化國內防疫量能，也呼應2050淨零碳排政策。賴總統回憶自己在擔任副總統時多次到訪疾管署，親眼見證防疫人員的辛勞，並表示這次動土象徵著健康台灣的一大步。他也勉勵防疫團隊勇敢前進，持續守護人民的健康與安全。
