首先是藥價可能被動上漲。洪子仁指出，美國藥廠為了不讓自家在美國的售價變低，會選擇調高像台灣這類「低價國」的藥品價格，尤其是昂貴的專利藥。這會讓健保負擔更重，甚至出現藥費吃掉健保預算的情況。
第二個風險是藥品供應中斷。美國藥廠主要提供台灣癌症、慢性病與抗生素等關鍵藥物。若廠商認為在台售價太低，恐怕會延後新藥上市、甚至乾脆不供貨，讓病人面臨「買不到藥」的危機。
第三是健保談判難度將大增。洪子仁指出，未來健保署在與藥廠議價時，可能遭到廠商要求提高價格，否則就改為自費銷售。過去靠學名藥省錢的策略，在新藥還有專利時就派不上用場，壓力會越來越大。
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洪子仁提醒，川普政策若上路，藥廠為了保住美國市場的價格優勢，勢必將壓力轉嫁到像台灣、加拿大、日本這些低價市場。健保要嘛提高給付、要嘛面對藥品缺貨，最壞情況是美國藥廠直接退出市場，台灣民眾的用藥權益將受到重大威脅。